01. R <- Plot 图像参数

大二的下学期学习了生物统计学，在课程的最后老师推荐我们学习一门变成语言，首先学习的是Python，因为做分析的时候得到的数据相对不完整，其实是我实在懒得自己编写程序去计算一些其它的量。最后决定开始学习R语言，因此此文权当我自身学习R语言做统计学分析时候的一点小总结和笔记吧。

使用的数据（集）

这篇文章中使用到的数据有R Studio还是R Language自带的 mtcars ：

以及一些方便演示而创建的数据集：

1	`data1 <- c(1,3,5,7,2,4,6,8)`

使用的Package

在绘图过程中，常用的包有很多，在下文中使用到的包也有很多交叉的地方，因为练习使用R语言的时候使用的是R Studio，这个软件的包管理做的简单明了，当有前置包需要载入的时候也会自动下载并载入，因此在此只列出所用package调用代码：

例：

1
2
3

> library(vcd)
载入需要的程辑包：grid #如vcd使用的前置包是grid，R studio便会自动载入grid
>

下面是相关代码：

1 2	`library(vcd) library(RColorBrewer)`

一、通用绘图操作

合并、新建、保存

1	`dev.new() #新建绘图窗口，避免图形覆盖`

参数的保存和使用

对于不同的图像，需要设置的参数可能也不同。

最简单的方法是直接在绘图函数后面设置相应的参数，如：plot(c(1,2,3), main = "Main Title")

第二种方法是直接改变全局变量：par(main = "Main Title")

第三种方法稍显复杂，但是它可以对于每一个图片进行设置，同时保留每个图片的相关设置：

opar <- par() #对当前的全局设置进行备份
par(pch = 2) #修改当前的全局设置
par_1 <- par() #对当前图像的相关参数进行存档
plot(c(1,2,3,4,5), main = "Not Main Title") #绘图
par(opar) #恢复默认的全局参数

图形的组合

在R中使用函数par()或layout()可以容易地组合多幅图形为一幅总括图形。

1. 直接修改par

你可以在par()函数中使用图形参数mfrow=c(nrows, ncols)来创建按行填充的、行数为nrows、列数为ncols的图形矩阵。另外，可以使用mfcol=c(nrows, ncols)按列填充矩阵。

例：

attach(mtcars) 

opar <- par(no.readonly=TRUE) 
par(mfrow=c(2,2)) #创建一副2行2列的总括图形
plot(wt,mpg, main="Scatterplot of wt vs. mpg") #绘制图一
plot(wt,disp, main="Scatterplot of wt vs. disp") #绘制图二
hist(wt, main="Histogram of wt") #绘制图三
boxplot(wt, main="Boxplot of wt") #绘制图四
par(opar) 

detach(mtcars)

2. 使用`layout()`

函数layout()的调用形式为layout(mat)，其中的mat是一个矩阵，它指定了所要组合的多个图形的所在位置。

mat 的含义如下：如 mat = matrix(c(1,1,2,3)), ，表示接下啦

layout()的调用格式为：

layout(mat, 
       widths = rep.int(1, ncol(mat)),
       heights = rep.int(1, nrow(mat)), 
       respect = FALSE)

例：

attach(mtcars) 
#设定一个2X2的绘图区域，沿着每一行进行填充
#第1，2个绘图位置分别放置第一幅图，第三个绘图位置方式第二幅图，第四个绘图位置放置第三幅图
layout(matrix(c(1,1,2,3), 2, 2, byrow = TRUE)) 
#绘图
hist(wt) 
hist(mpg) 
hist(disp) 

detach(mtcars)

为了更精确地控制每幅图形的大小，可以有选择地在layout()函数中使用widths=和heights=两个参数。其形式为：

1 2	`widths = 各列宽度值组成的一个向量 heights = 各行高度值组成的一个向量`

例：

attach(mtcars) 
#设定第一行的宽度为3，高度为1；设定第二行的宽度为1，高度为2
layout(matrix(c(1, 1, 2, 3), 2, 2, byrow = TRUE), 
 widths=c(3, 1), heights=c(1, 2)) 

hist(wt) 
hist(mpg) 
hist(disp) 

detach(mtcars)

二、绘图参数

通用的绘图参数对于基本绘图操作都有效，但是对于使用ggplot2包的情况来说，需要使用ggplot2的特殊方式来进行参数设置

使用绘图参数

绘图参数有很多，首先可以通过par()来查看所有的参数，也可以使用par()进行全局设置：

1 2	`par() #查看参数及现状设置 par(pch = 25, cex = 0.5) #对全局的某个或某些默认参数进行设置调整`

样式：符号 (点)、线条

1. 相关参数

参数	描述
pch (plotting character)	指定绘制点时使用的符号
cex	指定符号的大小。cex 是一个数值，表示绘图符号相对于默认大小的缩放倍数。默认大小为 1，1.5 表示放大为默认值的 1.5 倍，0.5 表示缩小为默认值的 50%，等等
lty	指定线条类型
lwd	指定线条宽度。lwd 是以默认值的相对大小来表示的（默认值为 1）。例如，lwd=2 将生成一条两倍于默认宽度的线条

2. 符号样式

例：

1 2	`data <- mtcars$mpg[2:5] #data <- c(21.0, 22.8, 21.4, 18.7) plot(data, pch = c(0,2,16,21))`

3. 线条类型

文本

参数	描述
main	主标题
sub	副标题
xlab	x轴名称
ylab	y轴名称
xlim	x轴坐标轴范围
ylim	y轴坐标轴范围
cex	表示相对于默认大小缩放倍数的数值。默认大小为 1，1.5 表示放大为默认值的 1.5 倍，0.5 表示缩小为默认值的 50%，等等
cex.axis	坐标轴刻度文字的缩放倍数。类似于 cex
cex.lab	坐标轴标签（名称）的缩放倍数。类似于 cex
cex.main	标题的缩放倍数。类似于 cex
cex.sub	副标题的缩放倍数。类似于 cex
font	整数。用于指定绘图使用的字体样式。1=常规，2=粗体，3=斜体，4=粗斜体，5=符号字体（以Adobe符号编码表示）
font.axis	坐标轴刻度文字的字体样式
font.lab	坐标轴标签（名称）的字体样式
font.main	标题的字体样式
font.sub	副标题的字体样式
ps	字体磅值（1磅约为1/72英寸）。文本的最终大小为ps*cex
family	绘制文本时使用的字体族。标准的取值为serif（衬线）、sans（无衬线）和mono（等宽）

例：

plot(rep(1,7),
        pch = 16,
        main = "The Main Title",
        sub = "The Sub Title",
        xlab = "The name of x-axis",
        ylab = "The name of y-axis",
        xlim = c(1,12),
        ylim = c(0,20),
        cex = 1.5,
        cex.axis = 0.5,
        cex.lab = 1.5,
        cex.sub = 1.5,
        font = 1,
        font.axis = 2,
        font.lab = 3,
        font.main = 4,
        font.sub = 1,
        ps = 12,
        family = "mono")

颜色

1. 参数

参数	描述
col (color)	图表内容的的绘图颜色。某些函数（如 lines 和 pie）可以接受一个含有颜色值的向量并自动循环使用。例如，如果设定 col=c(“red”, “blue”)并需要绘制三条线，则第一条线将为红色，第二条线为蓝色，第三条线又将为红色
col.axis	坐标轴刻度文字的颜色
col.lab	坐标轴标签（名称）的颜色
col.main	标题颜色
col.sub	副标题颜色
fg (foreground)	图形的前景色
bg (background)	填充色

对于符号21~25，可以指定边界颜色（col）和填充色（bg）
在R中，可以通过颜色下标、颜色名称、十六进制的颜色值、RGB值或HSV值来指定颜色。
- 举例来说，col=1、col="white"、col="#FFFFFF"、col=rgb(1,1,1) 和 col=hsv(0,0,1) 都是表示白色的等价方式。
- 函数rgb()可基于红－绿－蓝三色值生成颜色，而hsv()则基于色相－饱和度－亮度值来生成颜色。
  - rgb的取值范围是[0,1]，RGB的取值范围是[0,255]

举例：

colors <- rainbow(7)
barplot(rep(1,7),
       main = "The Main Title",
       sub = "The Sub Title",
       xlab = "The name of x-axis",
       ylab = "The name of y-axis",
       col = colors,
       col.axis = colors[1],
       col.lab = colors[2],
       col.main = colors[3],
       col.sub = colors[4],
       fg = colors[5],
       bg = colors[6])

常用十六进制颜色码

英文代码	形像颜色	HEX格式	RGB格式
LightPink	浅粉色 <- 示例	#FFB6C1	255,182,193
Pink	粉红 <- 示例	#FFC0CB	255,192,203
Crimson	猩红 <- 示例	#DC143C	220,20,60
LavenderBlush	偏红的淡紫色 <- 示例	#FFF0F5	255,240,245
PaleVioletRed	苍白的紫罗兰红色 <- 示例	#DB7093	219,112,147
HotPink	热情的粉红 <- 示例	#FF69B4	255,105,180
DeepPink	深粉色 <- 示例	#FF1493	255,20,147
MediumVioletRed	适中的紫罗兰红色 <- 示例	#C71585	199,21,133
Orchid	兰花的紫色 <- 示例	#DA70D6	218,112,214
Thistle	蓟 <- 示例	#D8BFD8	216,191,216
plum	李子 <- 示例	#DDA0DD	221,160,221
Violet	紫罗兰 <- 示例	#EE82EE	238,130,238
Light Purple	亮紫色 <- 示例	#FF00FF	255,0,255
Pure Purple	纯紫 <- 示例	#FF00FF	255,0,255
DarkPurple	深紫色 <- 示例	#8B008B	139,0,139
Purple	紫色 <- 示例	#800080	128,0,128
MediumOrchid	适中的兰花紫 <- 示例	#BA55D3	186,85,211
DarkVoilet	深蓝紫色 <- 示例	#9400D3	148,0,211
DarkOrchid	深兰花紫 <- 示例	#9932CC	153,50,204
Indigo	靛青 <- 示例	#4B0082	75,0,130
BlueViolet	深紫罗兰的蓝色 <- 示例	#8A2BE2	138,43,226
MediumPurple	适中的蓝紫色 <- 示例	#9370DB	147,112,219
MediumSlateBlue	适中的板岩暗蓝灰色 <- 示例	#7B68EE	123,104,238
SlateBlue	板岩暗蓝灰色 <- 示例	#6A5ACD	106,90,205
DarkSlateBlue	深岩暗蓝灰色 <- 示例	#483D8B	72,61,139
Lavender	薰衣草花的淡紫色 <- 示例	#E6E6FA	230,230,250
GhostWhite	幽灵的白色 <- 示例	#F8F8FF	248,248,255
Indigo Blue	靛蓝 <- 示例	#0000FF	0,0,255
MediumBlue	适中的蓝色 <- 示例	#0000CD	0,0,205
MidnightBlue	午夜的蓝色 <- 示例	#191970	25,25,112
DarkBlue	深蓝色 <- 示例	#00008B	0,0,139
Navy	海军蓝,深靛蓝 <- 示例	#000080	0,0,128
RoyalBlue	宝蓝 <- 示例	#4169E1	65,105,225
CornflowerBlue	矢车菊的蓝色 <- 示例	#6495ED	100,149,237
LightSteelBlue	淡钢蓝 <- 示例	#B0C4DE	176,196,222
LightSlateGray	浅石板灰 <- 示例	#778899	119,136,153
SlateGray	石板灰 <- 示例	#708090	112,128,144
DodgerBlue	道奇蓝 <- 示例	#1E90FF	30,144,255
AliceBlue	爱丽丝蓝 <- 示例	#F0F8FF	240,248,255
SteelBlue	钢蓝 <- 示例	#4682B4	70,130,180
LightSkyBlue	淡蓝色 <- 示例	#87CEFA	135,206,250
TianyiBlue	天依蓝 <- 示例	#66CCFF
SkyBlue	天蓝色 <- 示例	#87CEEB	135,206,235
DeepSkyBlue	深天蓝 <- 示例	#00BFFF	0,191,255
LightBLue	淡蓝 <- 示例	#ADD8E6	173,216,230
PowDerBlue	火药蓝 <- 示例	#B0E0E6	176,224,230
CadetBlue	军校蓝 <- 示例	#5F9EA0	95,158,160
Azure	蔚蓝色 <- 示例	#F0FFFF	240,255,255
LightCyan	淡青色 <- 示例	#E1FFFF	225,255,255
PaleTurquoise	苍白的绿宝石 <- 示例	#AFEEEE	175,238,238
Cyan	青色 <- 示例	#00FFFF	0,255,255
Aqua	水绿色 <- 示例	#00FFFF	0,255,255
DarkTurquoise	深绿宝石 <- 示例	#00CED1	0,206,209
DarkSlateGray	深石板灰 <- 示例	#2F4F4F	47,79,79
DarkCyan	深青色 <- 示例	#008B8B	0,139,139
Teal	水鸭色 <- 示例	#008080	0,128,128
MediumTurquoise	适中的绿宝石 <- 示例	#48D1CC	72,209,204
LightSeaGreen	浅海洋绿 <- 示例	#20B2AA	32,178,170
Turquoise	绿宝石 <- 示例	#40E0D0	64,224,208
BabyGreen	绿玉 <- 示例	#7FFFAA	127,255,170
MediumAquamarine	适中的碧绿色 <- 示例	#00FA9A	0,250,154
MediumSpringGreen	适中的春天的绿色 <- 示例	#F5FFFA	245,255,250
MintCream	薄荷奶油 <- 示例	#00FF7F	0,255,127
SpringGreen	春天的绿色 <- 示例	#3CB371	60,179,113
SeaGreen	海洋绿 <- 示例	#2E8B57	46,139,87
Honeydew	蜂蜜 <- 示例	#F0FFF0	240,255,0
LightGreen	淡绿色 <- 示例	#90EE90	144,238,144
PaleGreen	苍白的绿色 <- 示例	#98FB98	152,251,152
DarkSeaGreen	深海洋绿 <- 示例	#8FBC8F	143,188,143
LimeGreen	酸橙绿 <- 示例	#32CD32	50,205,50
Lime	纯绿,草绿色 <- 示例	#00FF00	0,255,0
ForestGreen	森林绿 <- 示例	#228B22	34,139,34
Green	深绿 <- 示例	#008000	0,128,0
DarkGreen	深绿色 <- 示例	#006400	0,100,0
Chartreuse	查特酒绿 <- 示例	#7FFF00	127,255,0
LawnGreen	草坪绿 <- 示例	#7CFC00	124,252,0
GreenYellow	绿黄色 <- 示例	#ADFF2F	173,255,47
OliveDrab	橄榄土褐色 <- 示例	#556B2F	85,107,47
Beige	米色（浅褐色） <- 示例	#6B8E23	107,142,35
LightGoldenrodYellow	浅秋麒麟黄 <- 示例	#FAFAD2	250,250,210
Ivory	象牙色 <- 示例	#FFFFF0	255,255,240
LightYellow	浅黄色 <- 示例	#FFFFE0	255,255,224
Yellow	柠檬黄 <- 示例	#FFFF00	255,255,0
Olive	橄榄绿 <- 示例	#808000	128,128,0
DarkKhaki	深卡其布 <- 示例	#BDB76B	189,183,107
LemonChiffon	柠檬薄纱 <- 示例	#FFFACD	255,250,205
PaleGodenrod	灰秋麒麟 <- 示例	#EEE8AA	238,232,170
Khaki	卡其布 <- 示例	#F0E68C	240,230,140
Gold	金 <- 示例	#FFD700	255,215,0
Cornislk	玉米色 <- 示例	#FFF8DC	255,248,220
GoldEnrod	秋麒麟 <- 示例	#DAA520	218,165,32
FloralWhite	花的白色 <- 示例	#FFFAF0	255,250,240
OldLace	老饰带 <- 示例	#FDF5E6	253,245,230
Wheat	小麦色 <- 示例	#F5DEB3	245,222,179
Moccasin	鹿皮鞋 <- 示例	#FFE4B5	255,228,181
Orange	橙色 <- 示例	#FFA500	255,165,0
PapayaWhip	番木瓜 <- 示例	#FFEFD5	255,239,213
BlanchedAlmond	漂白的杏仁 <- 示例	#FFEBCD	255,235,205
NavajoWhite	Navajo白 <- 示例	#FFDEAD	255,222,173
AntiqueWhite	古代的白色 <- 示例	#FAEBD7	250,235,215
Tan	晒黑 <- 示例	#D2B48C	210,180,140
BrulyWood	结实的树 <- 示例	#DEB887	222,184,135
Bisque	（浓汤）乳脂，番茄等 <- 示例	#FFE4C4	255,228,196
DarkOrange	深橙色 <- 示例	#FF8C00	255,140,0
Linen	亚麻布 <- 示例	#FAF0E6	250,240,230
Peru	秘鲁 <- 示例	#CD853F	205,133,63
PeachPuff	桃色 <- 示例	#FFDAB9	255,218,185
SandyBrown	沙棕色 <- 示例	#F4A460	244,164,96
Chocolate	巧克力 <- 示例	#D2691E	210,105,30
SaddleBrown	马鞍棕色 <- 示例	#8B4513	139,69,19
SeaShell	海贝壳 <- 示例	#FFF5EE	255,245,238
Sienna	黄土赭色 <- 示例	#A0522D	160,82,45
LightSalmon	浅鲜肉（鲑鱼）色 <- 示例	#FFA07A	255,160,122
Coral	珊瑚 <- 示例	#FF7F50	255,127,80
OrangeRed	橙红色 <- 示例	#FF4500	255,69,0
DarkSalmon	深鲜肉（鲑鱼）色 <- 示例	#E9967A	233,150,122
Tomato	番茄 <- 示例	#FF6347	255,99,71
MistyRose	薄雾玫瑰 <- 示例	#FFE4E1	255,228,225
Salmon	鲜肉（鲑鱼）色 <- 示例	#FA8072	250,128,114
Snow	雪 <- 示例	#FFFAFA	255,250,250
LightCoral	淡珊瑚色 <- 示例	#F08080	240,128,128
RosyBrown	玫瑰棕色 <- 示例	#BC8F8F	188,143,143
IndianRed	印度红 <- 示例	#CD5C5C	205,92,92
Red	纯红 <- 示例	#FF0000	255,0,0
Brown	棕色 <- 示例	#A52A2A	165,42,42
FireBrick	耐火砖 <- 示例	#B22222	178,34,34
DarkRed	深红色 <- 示例	#8B0000	139,0,0
Maroon	栗色 <- 示例	#800000	128,0,0
White	纯白 <- 示例	#FFFFFF	255,255,255
WhiteSmoke	白烟 <- 示例	#F5F5F5	245,245,245
Gainsboro	Gainsboro <- 示例	#DCDCDC	220,220,220
LightGray	浅灰色 <- 示例	#D3D3D3	211,211,211
Silver	银白色 <- 示例	#C0C0C0	192,192,192
DarkGray	深灰色 <- 示例	#A9A9A9	169,169,169
Gray	灰色 <- 示例	#808080	128,128,128
DimGray	暗淡的灰色 <- 示例	#696969	105,105,105
Black	纯黑 <- 示例	#000000	0,0,0

2. 使用包来获得颜色

R中预设了很多种颜色，可以通过colors()来查看当前可以使用的预设颜色

R中也有多种用于创建连续型颜色向量的函数，包括rainbow()、heat.colors()、terrain.colors()、topo.colors()以及cm.colors()。举例来说，rainbow(10)可以生成10种连续的“彩虹型”颜色。

与此同时，也可以使用第三方包RColorBrewer来选择一些吸引人的颜色：

library(RColorBrewer)

display.brewer.all() #查看该包给出的预设Color Set
display.brewer.pal("name") #查看某个Set中的具体元素

使用brewer.pal(n,"Set Name")来获得一个颜色值的向量，如：

brewer.pal(7,"Accent")

[1] "#7FC97F" "#BEAED4" "#FDC086" "#FFFF99" "#386CB0" "#F0027F" "#BF5B17"

barplot(rep(1,7),col=brewer.pal(7,"Accent"))

图形尺寸和边界尺寸

参数	描述
pin	以英寸表示的图形尺寸（宽和高）
mai	以数值向量表示的边界大小，顺序为“下、左、上、右”，单位为英寸
mar	以数值向量表示的边界大小，顺序为“下、左、上、右”，单位为英分①。默认值为 c(5, 4, 4, 2) + 0.1

在图片上继续修改

1. 标题

在已经绘制出一个图像的时候，可以在这张图的基础上继续修改

可以使用title()函数为图形添加标题和坐标轴标签。调用格式为：

title(main="main title", 
      sub="subtitle", 
      xlab="x-axis label", 
      ylab="y-axis label")

函数title()中亦可指定其他图形参数（如文本大小、字体、旋转角度和颜色）。举例来说，以下代码将生成红色的标题和蓝色的副标题，以及比默认大小小25%的绿色x轴、y轴标签：

title(main="My Title", 
      col.main="red", 
      sub="My Subtitle", 
      col.sub="blue", 
      xlab="My X label", 
      ylab="My Y label", 
      col.lab="green", 
      cex.lab=0.75)

2. 自定义坐标轴

可以使用函数axis()来创建自定义的坐标轴，而非使用R中的默认坐标轴。其格式为：

1	`axis(side, at=, labels=, pos=, lty=, col=, las=, tck=, ...)`

选项	描述
side	一个整数，表示在图形的哪边绘制坐标轴（1=下，2=左，3=上，4=右）
at	一个数值型向量，表示需要绘制刻度线的位置
labels	一个字符型向量，表示置于刻度线旁边的文字标签（如果为 NULL，则将直接使用 at 中的值）
pos	坐标轴线绘制位置的坐标（即与另一条坐标轴相交位置的值）
lty	线条类型
col	线条和刻度线颜色
las	标签是否平行于（=0）或垂直于（=2）坐标轴 numeric in {0,1,2,3}; the style of axis labels. 0: always parallel to the axis [default], 1: always horizontal, 2: always perpendicular to the axis, 3: always vertical. Also supported by mtext. Note that string/character rotation via argument srt to par does not affect the axis labels.
tck	刻度线的长度，以相对于绘图区域大小的分数表示（负值表示在图形外侧，正值表示在图形内侧，0表示禁用刻度，1表示绘制网格线）；默认值为–0.01
xaxt=”n”	禁用x坐标轴（会留下框架线，只是去除了刻度）
yaxt=”n”	禁用y坐标轴

3. 参考线

函数abline()可以用来为图形添加参考线。其使用格式为：

1	`abline(h=yvalues, v=xvalues)`

函数abline()中也可以指定其他图形参数（如线条类型、颜色和宽度）:

1	`abline(v=seq(1, 10, 2), lty=2, col="blue")`

举例：

1 2	`plot(rep(1,7),xlim = c(1,10)) abline(v=seq(1, 10, 2), lty=2, col="blue")`

4. 图例

当图形中包含的数据不止一组时，图例可以帮助你辨别出每个条形、扇形区域或折线各代表哪一类数据。我们可以使用函数legend()来添加图例：

1	`legend(location, title, legend, ...)`

选项	描述
location	有许多方式可以指定图例的位置。你可以直接给定图例左上角的x、y坐标，也可以执行`locator(1)`，然后通过鼠标单击给出图例的位置，还可以使用关键字`“bottomright”, “bottom”, “bottomleft”, “left”, “topleft”, “top”, “topright”, “right”, “center”`放置图例。如果你使用了以上某个关键字，那么可以同时使用参数inset=指定图例向图形内侧移动的大小（以绘图区域大小的分数表示）
title	图例标题的字符串（可选）
legend	图例标签组成的字符型向量
x, y	the x and y co-ordinates to be used to position the legend.
fill	if specified, this argument will cause boxes filled with the specified colors (or shaded in the specified colors) to appear beside the legend text
col	the color of points or lines appearing in the legend.
border	the border color for the boxes (used only if fill is specified).
lty, lwd	the plotting symbols appearing in the legend, as numeric vector or a vector of 1-character strings. Unlike points, this can all be specified as a single multi-character string. Must be specified for symbol drawing.
angle	angle of shading lines.
density	the density of shading lines, if numeric and positive. If NULL or negative or NA color filling is assumed.
bty	the type of box to be drawn around the legend. The allowed values are “o” (the default) and “n”.
bg	the background color for the legend box. (Note that this is only used if bty != “n”.)
box.lty, box.lwd, box.col	the line type, width and color for the legend box (if bty = “o”).
pt.bg	the background color for the points, corresponding to its argument bg.
cex	character expansion factor relative to current par(“cex”). Used for text, and provides the default for pt.cex.
pt.cex	expansion factor(s) for the points.
pt.lwd	line width for the points, defaults to the one for lines, or if that is not set, to par(“lwd”).
xjust	how the legend is to be justified relative to the legend x location. A value of 0 means left justified, 0.5 means centered and 1 means right justified.
yjust	the same as xjust for the legend y location.
x.intersp	character interspacing factor for horizontal (x) spacing.
y.intersp	the same for vertical (y) line distances.
adj	numeric of length 1 or 2; the string adjustment for legend text. Useful for y-adjustment when labels are plotmath expressions.
text.width	the width of the legend text in x (“user”) coordinates. (Should be a single positive number even for a reversed x axis.) Defaults to the proper value computed by strwidth(legend).
text.col	the color used for the legend text.
text.font	the font used for the legend text, see text.
merge	logical; if TRUE, merge points and lines but not filled boxes. Defaults to TRUE if there are points and lines.
trace	logical; if TRUE, shows how legend does all its magical computations.
plot	logical. If FALSE, nothing is plotted but the sizes are returned.
ncol	the number of columns in which to set the legend items (default is 1, a vertical legend).
horiz	logical; if TRUE, set the legend horizontally rather than vertically (specifying horiz overrides the ncol specification).
inset	inset distance(s) from the margins as a fraction of the plot region when legend is placed by keyword.
xpd	if supplied, a value of the graphical parameter xpd to be used while the legend is being drawn.
title.col	color for title.
title.adj	horizontal adjustment for title: see the help for par(“adj”).
seg.len	the length of lines drawn to illustrate lty and/or lwd (in units of character widths).
···	其他选项。如果图例标示的是颜色不同的线条，需要指定col=加上颜色值组成的向量。如果图例标示的是符号不同的点，则需指定pch=加上符号的代码组成的向量。如果图例标示的是不同的线条宽度或线条类型，请使用lwd=或lty=加上宽度值或类型值组成的向量。要为图例创建颜色填充的盒形（常见于条形图、箱线图或饼图），需要使用参数fill=加上颜色值组成的向量

举例：

dose <- c(20, 30, 40, 45, 60) 
drugA <- c(16, 20, 27, 40, 60) 
drugB <- c(15, 18, 25, 31, 40) 

opar <- par(no.readonly=TRUE) 
par(lwd=2, cex=1.5, font.lab=2) #增加线条、文本、符号、标签的宽度或大小

#以绘图drugA数据绘图
plot(dose, drugA, type="b", 
 pch=15, lty=1, col="red", ylim=c(0, 60),
 main="Drug A vs. Drug B", 
 xlab="Drug Dosage", ylab="Drug Response")
#添加drugB的数据
lines(dose, drugB, type="b", pch=17, lty=2, col="blue")

#添加次要刻度线，使用到了Hmisc包
library(Hmisc) 
minor.tick(nx=3, ny=3, tick.ratio=0.5)

#添加图例
legend("topleft", #location，位置
       inset=.05, 
       title="Drug Type", 
       legend = c("A","B"),
       lty=c(1, 2), 
       pch=c(15, 17), 
       col=c("red", "blue"))

par(opar)

5. 标注

文本标注

可以通过函数text()和mtext()将文本添加到图形上。

text()可向绘图区域内部添加文本，而mtext()则向图形的四个边界之一添加文本。

text()函数也通常用来标示图形中的点。我们只需指定一系列的x、y坐标作为位置参数，同时以向量的形式指定要放置的文本。x、y和文本标签向量的长度应当相同。

使用格式分别为：

1 2	`text(location, "text to place", pos, ...) mtext("text to place", side, line=n, ...)`

参数	描述
location	文本的位置参数。可为一对 x、y 坐标，也可通过指定 location 为 locator(1)使用鼠标交互式地确定摆放位置
pos	文本相对于位置参数的方位。1=下，2=左，3=上，4=右。如果指定了 pos，就可以同时指定参数 offset= 作为偏移量，以相对于单个字符宽度的比例表示
side	指定用来放置文本的边。1=下，2=左，3=上，4=右。你可以指定参数 line=来内移或外移文本，随着值的增加，文本将外移。也可使用 adj=0 将文本向左下对齐，或使用 adj=1 右上对齐

例：

attach(mtcars) 
#使用mtcars预设数据绘图
plot(wt, mpg,  #使用wt，mpg的值作为x, y坐标
     main="Mileage vs. Car Weight", 
     xlab="Weight", ylab="Mileage", 
     pch=18, col="blue") 
#进行标注
text(wt, mpg, #x, y坐标是原先plot时候的x, y值
     row.names(mtcars), #读取mtcars每一行的标签
     cex=0.6, pos=4, col="red") 

detach(mtcars)

数学标注

可以使用类似于 TeX 中的写法为图形添加数学符号和公式。

要即时看效果，可以尝试执行demo(plotmath)。

函数plotmath()可以为图形主体或边界上的标题、坐标轴名称或文本标注添加数学符号。

软件使用总结 > R

#速查 #R #Statistics

01. R <- Plot 图像参数

https://zhenyumi.github.io/posts/5542a9bf/

作者

向海

发布于

2020年7月12日

更新于

2020年7月17日

许可协议

常用颜色代码上一篇

00. R <- 数据类型下一篇

01. R <- Plot 图像参数

使用的数据（集）

使用的Package

一、通用绘图操作

合并、新建、保存

参数的保存和使用

图形的组合

1. 直接修改par

2. 使用layout()

二、绘图参数

使用绘图参数

样式：符号 (点)、线条

1. 相关参数

2. 符号样式

3. 线条类型

文本

颜色

1. 参数

常用十六进制颜色码

2. 使用包来获得颜色

图形尺寸和边界尺寸

在图片上继续修改

1. 标题

2. 自定义坐标轴

3. 参考线

4. 图例

5. 标注

文本标注

数学标注

2. 使用`layout()`